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氯代邻苯二酚1,2-双加氧酶基因的克隆及其定量表达
摘要点击 1859  全文点击 1165  投稿时间:2008-01-09  修订日期:2008-01-09
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中文关键词  铜绿假单胞菌  氯代邻苯二酚1,2-双加氧酶  1,2,4-三氯苯  实时荧光定量反转录-PCR
英文关键词  Pseudomonas aeruginosa  chlorocatechol 1,2-dioxygenase  1,2,4-trichlorobenzene  real-time reverse transcription-PCR
作者单位
宋蕾 内蒙古工业大学建筑工程学院呼和浩特010051 
王慧 清华大学环境科学与工程系环境模拟与污染控制国家重点联合实验室北京100084 
施汉昌 清华大学环境科学与工程系环境模拟与污染控制国家重点联合实验室北京100084 
中文摘要
      从1,2,4-三氯苯降解菌铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)J5-2的总DNA中,利用PCR方法克隆到氯代邻苯二酚1,2-双加氧酶基因,命名为tcbC(J5-2) (GenBank登录号EF111021).分析tcbC(J5-2)基因的氨基酸序列后发现,该基因不同于已见报道的1,2,4-三氯苯降解菌Pseudomonas sp.P51中的氯代邻苯二酚1,2-双加氧酶基因tcbC(P51),与其同源性仅为95%.tcbC(J5-2)基因在48、 52和73这3个关键位置的氨基酸分别为Leu(亮氨酸)、Ala(丙氨酸)和Ile(异亮氨酸),而tcbC(P51)基因分别为Val(缬氨酸)、Ala(丙氨酸)和Met(蛋氨酸).利用实时荧光定量反转录-PCR(real-time reverse transcription-PCR)方法,考察了菌株J5-2在分别以1,2-二氯苯、 1,3-二氯苯和1,2,4-三氯苯为唯一碳源时tcbC(J5-2)基因的定量表达.结果表明, 1,2,4-三氯苯对tcbC基因的诱导作用更强.
英文摘要
      The chlorocatechol 1,2-dioxygenase gene,designated as tcbC(J5-2) (GenBank Accession No.EF111021),was cloned from total DNA of Pseudomonas aeruginosa J5-2 which can degrade 1,2,4-trichlorobenzene.The deduced amino acid sequence analysis of tcbC(J5-2) shows that it is different from tcbC(P51) cloned from another 1,2,4-trichlorobenzene-degrader Pseudomonas sp.P51.tcbC(J5-2) is only 95% similar to tcbC(P51) at the amino acid level.Three critical amino acid residues in tcbC (J5-1) are Leu-48,Ala-52,and Ile-73.Otherwise,they are Val-48,Ala-52,and Met-73 in tcbC (P51).mRNA accumulation of tcbC in J5-2 was quantified by real-time reverse transcription-PCR,when J5-2 grew on 1,2-dichlorobenzene, 1,3-dichlorobenzene and 1,2,4-trichlorobenzene respectively.The results show that 1,2,4-trichlorobenzen is a better inducer than 1,2- and 1,3-dichlorobenzene.

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