| 昌黎县海域细菌群落和抗生素抗性基因分析 |
| 摘要点击 733 全文点击 172 投稿时间：2023-01-06 修订日期：2023-03-13 |
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| 中文关键词 昌黎县 海水养殖 海水 底泥 肠道内容物 微生物多样性 抗生素抗性基因（ARGs） |
| 英文关键词 Changli County marine aquaculture seawater sediment gut content microbial diversity antibiotic resistance gene（ARGs） |
| 作者 | 单位 | E-mail | | 王秋水 | 北京市科学技术研究院分析测试研究所(北京市理化分析测试中心), 北京 100089 | wangqius9182901@hotmail.com | | 程波 | 中国水产科学研究院, 农业农村部水产品质量安全控制重点实验室, 北京 100141 | chengb@cafs.ac.cn | | 刘悦 | 北京市科学技术研究院分析测试研究所(北京市理化分析测试中心), 北京 100089 | | | 邓婕 | 北京市科学技术研究院分析测试研究所(北京市理化分析测试中心), 北京 100089 | | | 徐岩 | 中国水产科学研究院北戴河中心试验站, 秦皇岛 066100 | | | 孙朝徽 | 中国水产科学研究院北戴河中心试验站, 秦皇岛 066100 | | | 袁立艳 | 北京市科学技术研究院分析测试研究所(北京市理化分析测试中心), 北京 100089 | | | 左嘉 | 北京市科学技术研究院分析测试研究所(北京市理化分析测试中心), 北京 100089 | | | 司飞 | 中国水产科学研究院北戴河中心试验站, 秦皇岛 066100 | | | 高丽娟 | 北京市科学技术研究院分析测试研究所(北京市理化分析测试中心), 北京 100089 | aglj889@163.com |
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| 中文摘要 |
| 为了解秦皇岛昌黎县水产养殖海域微生物分布情况及各种抗性基因的污染状况,使用高通量测序技术,采用16S rDNA基因测序和宏基因组测序方法对春季养殖海域中的海水、底泥及土著鱼类矛尾复鰕虎鱼肠道内容物进行研究.结果表明,海水中以变形菌门（Proteobacteria）、厚壁菌门（Firmicutes）和拟杆菌门（Bacteroidota）为主要优势菌门；底泥中以变形菌门（Proteobacteria）、泉古菌门（Crenarchaeota）、酸杆菌门（Acidobacteriota）和放线菌门（Actinobacteriota）为主；鰕虎鱼肠道内容物以变形菌门（Proteobacteria）、蓝藻细菌（Cyanobacteria）、厚壁菌门（Firmicutes）和拟杆菌门（Bacteroidota）为主.底泥样本中的微生物多样性最丰富,其次是海水样本,鱼类肠道内容物的微生物多样性最低.且不同位点的同类样本之间微生物多样性较为相似,同一位点的不同类样本中的微生物多样性差别较大.对于不同位点的样本,各位点海水样本之间微生物群落结构均存在显著差异,各位点底泥样本之间差异较小,且有些底泥样本组间不存在显著的微生物组成差异.在所有样本组中,检测到的抗性基因主要为：β-内酰胺类抗生素抗性基因有5个（blaOXA-325、cepS、blaCARB-20、blaOXA-55和blaTRU-1）,氨基糖苷类抗生素抗性基因有4个[aac（6'）-IIb、amrA、aac（6'）-Ie-aph（2″）-Ia和aph（3'）-Vc].抗生素抗性基因与微生物群落之间也存在一定的相关性. |
| 英文摘要 |
| In order to understand the distribution of microorganisms and various antibiotic resistance genes in the aquaculture area of Changli County, Qinhuangdao, high-throughput sequencing technology was used in this study. We utilized 16S rDNA gene sequencing and metagenome sequencing methods to analyze the seawater, sediment, and gut contents of the local fish Synechogobius hasta in the aquaculture area in spring. The results showed that Proteobacteria, Firmicutes, and Bacteroidota were the dominant bacteria in seawater; and Proteobacteria, Crenarchaeota, Acidobacter, and Actinobaciota were rich in the sediment; whereas Proteobacteria, Cyanobacteria, Firmicutes, and Bacteroidota were in relatively high abundance in fish gut contents. The microbial diversity of sediment samples was the most abundant, followed by seawater samples, and the microbial diversity of fish intestinal contents was the lowest. Moreover, the microbial diversity of similar samples was relatively similar, and the microbial diversity of different types of samples was quite different. For samples at different sites, there were significant differences between seawater samples at each site, and there were small differences between sediment samples at each site, and some sediment sample groups did not have significant differences in microbial composition. In all sample groups, five β-lactam antibiotic resistance genes (blaOXA-325, cepS, blaCARB-20, blaOXA-55, and blaTRU-1) and four aminoglycoside antibiotic resistance genes[aac(6')-IIb, amrA, aac(6')-Ie-aph(2″)-Ia, and aph(3')-Vc] were detected. There was also a certain correlation between antibiotic resistance genes and microbial communities. |
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