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长期施用猪粪水稻土抗生素抗性基因污染研究
摘要点击 3822  全文点击 1938  投稿时间:2014-03-13  修订日期:2014-04-17
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中文关键词  猪粪  水稻土  抗生素  抗生素抗性基因  高通量定量PCR
英文关键词  manure  paddy soil  antibiotic  antibiotic resistance genes  high-throughput qPCR
作者单位E-mail
黄福义 中国科学院城市环境研究所, 厦门 361021
中国科学院大学, 北京 100049 
fyhuang@iue.ac.cn 
李虎 中国科学院城市环境研究所, 厦门 361021
中国科学院大学, 北京 100049 
 
韦蓓 中国科学院城市环境研究所, 厦门 361021
中国科学院大学, 北京 100049 
 
欧阳纬莹 中国科学院城市环境研究所, 厦门 361021
中国科学院大学, 北京 100049 
 
苏建强 中国科学院城市环境研究所, 厦门 361021 jqsu@iue.ac.cn 
中文摘要
      为了全面研究猪粪有机肥对水稻土抗生素抗性及分布格局的影响,选择295对抗生素抗性基因引物,采用高通量荧光定量PCR对水稻土中的抗生素抗性基因污染情况进行了研究. 结果表明,未施用猪粪水稻土检测出66种抗性基因,而施用猪粪水稻土则检测出107种抗生素抗性基因,施用猪粪后水稻土中抗生素抗性基因种类显著增加(P<0.05). 相对于未施用猪粪水稻土,施用猪粪水稻土有49种抗生素抗性基因丰度显著增加(P<0.05),其中施用猪粪水稻土中喹诺酮类/氯霉素类抗性基因的mexF的丰度相对于未施用猪粪水稻土增加1791倍. 高通量定量结果表明,施用猪粪的水稻土抗生素抗性基因分布格局发生显著变化,高通量定量技术是研究环境抗生素抗性基因的一个非常实用的工具.
英文摘要
      To investigate the effect of long-term manure application on the profiles of antibiotic resistance genes (ARGs) in paddy soil, the abundance of ARGs targeted by 295 primers sets were measured by using high-throughput quantitative PCR technique. A total of 107 types of ARGs were detected in long-term manured paddy soil, which is significantly higher than that in control paddy soil (P<0.05). PCA analysis and UPGMA cluster demonstrated that long-term manure application significantly changed the ARGs diversity and abundance in paddy soils. There were 49 types antibiotic resistance genes were enriched significantly in paddy soil applied with manure (P<0.05), especially the mexF, which belongs to quinolones-chloramphenicol resistance genes, increased 1791-fold compared with paddy soil of no manure application. Our results showed that long-term application of manure in paddy soil resulted in the shift of abundance and diversity of ARGs, high-throughput quantitative PCR could be a powerful tool concerning the environmental ARGs dimensions.

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