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淡水水体底泥中厌氧氨氧化菌的原位鉴别
摘要点击 2261  全文点击 1520  投稿时间:2005-07-10  修订日期:2005-09-15
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中文关键词  氮循环  厌氧氨氧化菌  淡水水体底泥  分子生物学技术
英文关键词  nitrogen cycle  ANAMMOX bacteria  freshwater sediment  molecular techniques
DOI    10.13227/j.hjkx.20060732
作者单位
阮晓红 河海大学水文水资源与水利工程科学国家重点实验室 南京210098 
张瑛 河海大学水文水资源与水利工程科学国家重点实验室 南京210098 
Markus C.Schmid Department of Microbiology Radboud University of Nijmegen,Toernooiveld1
6525 ED Nijmegen
The Netherlands 
Toine Smits 4.Center for Water and Society
Radboud University of Nijmegen,Toeronooiveld1
6500 GL Nijmegen
The Netherlands 
赵振华 河海大学水文水资源与水利工程科学国家重点实验室 南京210098 
中文摘要
      采用16S rRNA方法对江苏省新沂河的底泥样品进行了厌氧氨氧化菌的原位检测,建立了样品的16S rRNA克隆文库,共包括6个16S rRNA克隆序列.对文库中克隆序列利用ARB软件包进行了排队分析及系统发育树的绘制.分析结果表明,新沂河底泥样品中含有与已知厌氧氨氧化菌Candidatus“Brocadia anammoxidans”相似性为91%的16S rRNA基因,经鉴定为厌氧氨氧化菌Brocadia分支的新种类.样品中还含有组成Planctomycetes新分支的16S rRNA基因,它们与已知厌氧氨氧化菌序列的遗传距离较远,其微生物特性还有待进一步研究.厌氧氨氧化菌在淡水环境中的发现将有助于进一步研究厌氧氨氧化过程在受损淡水生态系统修复重建中的作用,重新认识其中的氮循环过程.
英文摘要
      In situ identification of ANAMMOX bacteria was conducted using 16S rRNA approach for sediment samples from the Xinyi River in Jiangsu Province,China. 16S rRNA clone library including 6 clone sequences was constructed.The alignment of these sequences and treeing were conducted using ARB package.Results show that the sediment samples contained 16S rRNA genes closely related to the known ANAMMOX bacterium Candidatus "Brocadia anammoxidans"(similarity of 91%).They also contained 16S rRNA gene sequences from a new branch of Planctomycetes distantly related to the ANAMMOX sequence cluster.However,the microbiological characteristics of these Planctomycetes are to be studied in the future.The detection of ANAMMOX bacteria will lead to further research on ANAMMOX process in the remediation and restoration of freshwater aquatic ecosystems and new understanding of the nitrogen cycle.

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