环境科学  2015, Vol. 36 Issue (7): 2496-2503   PDF    
全氟化合物对表层沉积物中细菌群落结构的影响
孙雅君1,2, 王铁宇2 , 彭霞薇1 , 王佩2,3    
1. 北京林业大学生物科学与技术学院, 北京 100083;
2. 中国科学院生态环境研究中心, 北京 100085;
3. 中国科学院大学, 北京 100049
摘要:选择集中分布氟化工相关企业的山东省小清河水系,自上游至莱州湾入海口采集10个表层沉积物样点(XQ1~XQ10),采用高效液相色谱/质谱联用(HPLC/MS-MS)监测全氟化合物(perfluoroalkyl substances, PFASs),分析影响细菌群落结构的基础环境因子,提取细菌DNA并运用第二代Illumina MiSeq测序技术分析其细菌群落结构. 结果表明,在小清河流域沉积物中12种PFASs均有不同程度检出,并以全氟辛酸(PFOA)为主,生产企业集中区下游样点XQ5的PFOA 浓度在4、7月分别高达456.2 ng ·g-1和748.7 ng ·g-1. PFOA是小清河4月影响微生物群落结构的关键因子,与群落丰富度和均匀度呈显著负相关; 硫杆菌属(Thiobacillus)在低浓度PFOA条件下数量较少,但在高浓度PFOA下数量较高且成为优势菌种,初步证明硫杆菌属是PFOA污染响应的敏感物种,有作为指示微生物的潜质; PFOA在浓度较低时(<100 ng ·g-1)对微生物群落结构的影响不显著.
关键词全氟化合物     全氟辛酸     微生物群落     环境因子     沉积物     冗余分析    
Effects of Perfluoroalkyl Substances on the Microbial Community Structure in Surface Sediments of Typical River, China
SUN Ya-jun1,2, WANG Tie-yu2 , PENG Xia-wei1 , WANG Pei2,3    
1. College of Biological Sciences and Technology, Beijing Forestry University, Beijing 100083, China;
2. Research Center for Eco-Environmental Sciences, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100085, China;
3. University of Chinese Academy of Sciences, Beijing 100049, China
Abstract: In order to reveal the relationship between Perfluoroalkyl substances (PFASs) contamination and the bacterial community composition, surface sediment samples were collected along the Xiaoqing River in Shandong Province in April and July 2014 (XQ1-XQ10), where many PFASs manufacturers were located. PFASs were quantified by HPLC/MS-MS, related environmental factors affecting the microbial community structure were measured, and the microbial community structure in surface sediments was measured by the second-generation sequencing technology Illumina MiSeq. The results not only revealed the degree of PFASs pollution in the sediments of Xiaoqing River, but also illustrated the relationship between PFASs pollution and the microbial community structure. Among the twelve kinds of PFASs detected in this study, PFOA was the predominant compound, and the highest PFOA concentrations were detected in the sample of XQ5 (April: 456.2 ng ·g-1; July: 748.7 ng ·g-1) located at the downstream of Xiaoqing River with many fluoropolymer producing facilities. PFOA contamination was the main factor affecting the microbial community structure in April, accordingly community richness and evenness were significantly negatively correlated with PFOA levels. The abundance of Thiobacillus increased with the increasing PFOA concentration in the sediment PFOA. This suggested that Thiobacillus was sensitive to PFOA pollution and might be the potential indicator to reveal the degree of PFOA pollution in sediment. When the concentrations of PFOA were below 100 ng ·g-1, no significant effects on the microbial community structure were observed.
Key words: perfluoroalkyl substances     PFOA     microbial community     environmental factors     sediment     redundancy analysis    

全氟化合物(perfluoroalkyl substances,PFASs)具有化学稳定性、 高表面活性、 疏水疏油和耐热性等优良特性. 自20世纪中期被广泛用于农药、 造纸、 黏合剂和石油化工等工业生产和民用领域[1,2]. 由于大规模的生产使用,PFASs已在全球范围内不同的环境介质以及野生动物和人体内被检出[1,3]. 其中全氟辛酸(perfluorooctanoic acid,PFOA) 和全氟辛烷基磺酸(perfluorooctane sulfonate,PFOS)是目前应用最广泛的两种PFASs,也是多种其他PFASs 在环境中的最终转化产物[4]. 2009年PFOS及其盐类被正式列入《关于持久性有机污染物(POPs)的斯德哥尔摩公约》,成为一类使用和排放受到严格制约的PFASs,而PFOA虽受一些发达国家的管控,但在我国仍存在一定规模的生产和排放[5]. 目前,国内外关于PFOA和PFOS对生态系统的毒性研究多集中在针对模式动物的肝脏毒性、 遗传和免疫毒性、 生殖和发育毒性、 内分泌干扰效应和潜在致癌性等方面[7],而其对植物和微生物生态效应的研究涉及不多,关于PFASs对细菌群落变化可能造成影响方面的研究更是几乎没有.

前期调查研究发现[6],位于山东的小清河流域集中分布较大规模的PFASs类物质生产企业,环境样品中具有较高浓度的PFOA. 因此,本研究从该地区采集受不同程度PFASs污染的表层沉积物样品,分析沉积物中PFASs的含量和相关理化指标,采用第二代Illumina MiSeq测序技术分析细菌群落多样性[8]. 而且,采用冗余分析方法探索了PFOA污染和微生物群落结构变化之间的内在联系,以期为揭示PFOA对微生物群落的生态效应及风险评价提供相关理论依据.

1 材料与方法 1.1 研究区概况

小清河位于山东省中部,发源于济南市,于寿光县羊口镇入海.据调查,山东省的氟聚合物生产企业主要分布在小清河沿岸,并在淄博市桓台县形成产业集聚(XQ5点位附近,图 1),主要工业产品包括含氟制冷剂、 生产农药和药物的中间体、 聚四氟乙烯(PTFE)和四氟乙烯(TFE)等[6]. 截至2012年底,上游附近氟工业区平均年产3.7万t PTFE、 5万t TFE、 1万t六氟丙烯和超过20万t不同的氟化制冷剂[9]. 前期调查研究表明沉积物样品中所检测的17种PFASs,共12种有不同程度地检出,生产企业排放的工业废水使得小清河中PFOA的暴露水平高达3 648.6 kg ·a-1,显著高于国内外其它区域PFOA的暴露量[6].

1.2 样品的采集和处理

分别于2014年4月和7月用底泥采样器(WHL15-HL-CN型)采集10个0~15 cm表层沉积物样品(图 1),每一样点将2 m×2 m面积的四周及中间共5 份表层沉积物混匀,装入聚丙烯塑料瓶,样品立即置于冰盒保存和运输,返回实验室后取一部分置于-20℃保存,供细菌分子生物学分析,其余样品室内风干、 研磨、 过2 mm筛,用于PFASs 和理化性质分析.

图 1 小清河流域沉积物采样点位分布示意 Fig. 1 Sediment sampling sites along the Xiaoqing River

1.3 PFASs 的测定 1.3.1 试剂和仪器

12种PFASs包括全氟丁酸(perfluorobutanoic acid,PFBA)、 全氟戊酸(perfluoropentanoic acid,PFPeA)、 全氟己酸(perfluorohexanoic acid,PFHxA)、 全氟庚酸(perfluoroheptanoic acid,PFHpA)、 全氟辛酸(perfluorooctanoic acid,PFOA)、 全氟壬酸(perfluorononanoic acid,PFNA)、 全氟癸酸(perfluorodecanoic acid,PFDA)、 全氟十一酸(perfluoroundecanoic acid,PFUdA)、 全氟十二酸(perfluorododecanoic acid,PFDoA)、 全氟丁烷磺酸(perfluorobutane sulfonate,PFBS)、 全氟己烷磺酸(perfluorohexane sulfonate,PFHxS)和全氟辛烷磺酸(perfluorooctane sulfonate,PFOS). PFASs和质量标记物纯度均>98% (Wellington 实验室,加拿大). 乙酸铵(~98%)、 氨水(28%~30% NH3 basis)、 氢氧化钠和盐酸(HCl,≥37%)均购自Sigma-Aldrich公司(St. Louis,美国),色谱纯甲醇和乙腈购自J.T. Baker公司(Phillipsburg,美国).

Supelco ENVI-Carb 净化小柱(250 mg,3 mL)购自Sigma-Aldrich公司(St. Louis,美国),Oasis WAX固相萃取小柱(6 cc,150 mg,30 μm)购自Waters 公司(Milford,美国,氮吹仪所用高纯氮纯度>99.999%,安捷伦1290 高效液相系统串联安捷伦6460三重四级杆质谱系统(安捷伦科技,Palo Alto,美国),超声清洗机(KQ5200型,中国昆山).

1.3.2 样品前处理及仪器分析

称取2 g沉积物样品置于50 mL聚丙烯离心管,加入2 mL 100 mmol ·L-1 NaOH 的乙腈水溶液(乙腈 ∶水,8 ∶2),超声30 min,然后加入20 mL 乙腈,振荡30 min,再加入2 mol ·L-1盐酸溶液0.1 mL 后在3 000 r ·min-1离心15 min. 取上清液置于另一50 mL离心管,剩余物质加入10 mL乙腈,重复上述步骤一次,两次获得的上清液置于同一个离心管,用高纯氮气吹至1 mL浓缩液. 该1 mL萃取液继续用ENVI-Carb和OASIS-WAX固相萃取小柱净化. Envi-Carb小柱用3次1 mL乙腈活化后,将1 mL浓缩液过柱收集,并再次用3次1 mL乙腈清洗小柱,将4 mL收集到的浓缩液加超纯水稀释至100 mL,再用OASIS WAX小柱净化. OASIS WAX小柱依次用4 mL 0.1%的氨水/甲醇溶液、 4 mL甲醇及4 mL超纯水活化后,将100 mL稀释液过柱,使溶液中的PFASs 吸附在柱上,而后用4 mL 25 mmol ·L-1醋酸铵淋洗. 风干小柱后用4 mL甲醇和4 mL 0.1%氨水/甲醇溶液洗脱,整个固相萃取过程将流速控制在每秒1滴. 将洗脱液高纯氮气吹至1 mL,过0.22 μm尼龙滤膜,进行HPLC /MS-MS 检测[6].

1.3.3 色谱-质谱条件

液相系统所用色谱柱为Agilent ZORBAX Eclipse Plus C18,2.1 mm×100 mm,3.5 μm,前接3 μm在线过滤器,柱温40℃,进样量5 μL. 流动相为2 mmol ·L-1乙酸铵(A)和乙腈(B),流速0.3 mL ·min-1,初始比例为80%A和20%B,保持0.5 min,经8 min变为10%A和90%B,保持2 min后,回到初始状态保持5 min. 质谱条件为电喷雾电离负源(ESI-),雾化温度350℃,雾化器压力40 psi,辅助气(N2)流量9 L ·min-1,毛细管电压3 500 V.

1.3.4 质量控制及保证

在样品采集过程中,除用聚丙烯瓶盛装外,另用3层聚丙烯袋做密封处理,并设置场地空白和运输空白. 分析过程中严格控制并避免了含氟材料特别是PTFE的使用. 所有实验容器和装置在使用前均经超纯水和甲醇预处理,分析过程加入程序空白、 试剂空白和回收率等质控处理. 采用内标法定量,PFASs基质加标回收率为75%~117%. 检测限(LOD)和定量限(LOQ)分别设定为信噪比(S/N)>3和>10的浓度,其中LOD(以干重计)为0.002~0.01 ng ·g-1,LOQ(以干重计)为0.01~0.04ng ·g-1. 标准偏差均在合理范围内(±20%),所有空白处理均低于检测限.

1.4 主要环境因子的测定

沉积物pH 值、 总氮(TN) 分别用pH 计(W样品 ∶超纯水=1 ∶2.5)、 凯氏定氮法测定,全磷(TP)选用酸溶-钼锑抗比色法(LY /T 1232-1999)[10]和紫外可见分光光度计(UV2700,日本岛津公司)比色测定,有机碳(TOC)采用催化燃烧法[11]并用总碳分析仪(型号:Multi N/C 3100,德国Analytik jena公司)测定,沉积物的颗粒组成根据土壤粒级划分标准[12]用激光衍射系统Malvern Master Sizer 2000 (MalvernCo,英国)测定,水体电导率和溶解氧采用智能多参数水质分析仪(5B-2H,北京连华)进行测定.

1.5 微生物群落结构分析

1.5.1 DNA提取和MiSeq测序流程

DNA提取:称取沉积物样品0.5~0.7 g,采用DNA提取试剂盒Fast DNA SPIN Kit for Soil(MP Biomedicals,美国),按说明书步骤提取总DNA,利用1%琼脂糖凝胶电泳检测DNA 纯度和浓度,最终使用无菌水稀释样品至1 ng ·μL-1.

PCR扩增:16S rDNA的V4去扩增[13],使用带Barcode的特异性引物515F: 5′-GTGCCAGCMGCCG CGGTAA-3′,引物806R:5′-GGACTACHVGGGTWT CTAAT-3′. PCR的反应体系为每30μL反应混合液包含:15 μL Phusion High-Fidelity PCR Master Mix with GC Buffer(New England Biolabs,美国),细菌DNA模板10 μL,引物3 μL和2 μL的H2O. PCR扩增在Bio-rad T100梯度PCR 仪上进行,反应条件为: 98℃预变性1 min; 随后进行30个PCR扩增 (98℃变性10 s,50℃退火30 s,72℃延伸30 min); 最后72℃延伸5 min. PCR 产物用2%的琼脂糖凝胶电泳检测. 根据PCR 产物浓度进行等浓度混样,充分混匀后使用1×TAE 浓度2%的琼脂糖凝胶电泳纯化PCR产物,割胶回收目标条带. 使用NEB Next UltraTM DNA Library Prep Kit for Illumina建库试剂盒(New England Biolabs,美国)进行文库构建,经Qubit 荧光定量和Agilent Bioanalyzer 2100 system文库检测合格后,使用Illumina公司的MiSeq平台进行250 bp/300bp双末端测序法上机测序.

1.5.2 信息分析流程和OTU列表生成

利用双末端(Paired-End)测序得到的原始数据,存在一定比例的干扰数据. 首先对原始数据进行拆分,去除末端接头序列和引物序列,并截去barcode序列和PCR扩增引物序列,再将拆分的数据使用FLASH (V1.2.7,http://ccb.jhu.edu/software/FLASH/)对每个样品进行拼接[14],过滤去除序列集合中长度小于平均长度70%的序列,并去除其中的嵌合体序列,最终得到有效数据(Clean Tags). 用QIIME[15]和UPARSE软件(http://drive5.com/uparse/)[16]对序列进行聚类,根据97%相似性将序列聚类成OTU(Operational taxonomic units),并为每个OTU选取代表序列进行注释[13],从而得到每个样品的OTU和分类谱系的基本分析结果.

1.5.3 微生物群落结构分析

对样品OTU进行丰度、 多样性指数等分析,其中Chao 指数和Observed_species分析均是对物种丰富度的直观反映,Shannon指数既考虑到样品中分类总数,也包含每个分类所占的比例. 结合三方面不同alpha多样性指数的整合分析,可知样品内群落的多样性、 均匀度等信息. 在以上分析基础上,进行聚类分析、 RDA统计比较分析,挖掘样品间的物种组成差异和环境因子的相关性.

1.6 数据处理和分析

采用Microsoft Excel和SPSS 19.0软件(Pearson相关性分析)对数据进行分析. 使用CANOCO 5.0软件对MiSeq测序揭示的细菌群落结构与环境因子进行冗余分析(redundancy analysis,RDA).

2 结果与讨论 2.1 小清河表层沉积物中PFASs的暴露水平

沉积物样品中所检测的12种PFASs,均有不同程度检出. 如图 2所示,两次采样PFASs含量分别为8.5~465.6 ng ·g-1和1.3~803.5 ng ·g-1,平均值分别为109.5 ng ·g-1和104.3 ng ·g-1. 各个沉积物样点浓度最高的PFASs均是PFOA,含量分别为3.8~456.2 ng ·g-1和0.6~748.7 ng ·g-1,平均值为103.1 ng ·g-1和96.3 ng ·g-1. PFASs浓度最高的XQ5点位在两个月份PFOA的含量分别达456.2 ng ·g-1和748.7 ng ·g-1,占PFASs的97.9%和93.2%. 高浓度的PFOA证明该区域存在点源污染且已证实污染源位于XQ5上游[6],其它点位PFOA浓度相对低应是由于小清河主河道的稀释作用. 沉积物中较高水平的PFOA暴露与前期该流域水体研究结果相一致[6,17].

图 2 4月和7月沉积物样点PFASs浓度 Fig. 2 PFASs concentrations of sediments samples in April and July, 2014

有研究表明,环渤海11条水系河道内和沿海沉积物中PFAS平均值为0.535 ng ·g-1和0.578 ng ·g-1,且最高值均未超过2 ng ·g-1,PFOA仅占其中的8%和30%[17]. Meng等[18]根据平衡分配预测沉积物中PFOA的无效应浓度参考值为0.70 μg ·g-1. 据此可知,小清河流域PFOA浓度显著高于其它环渤海水系,且7月污染源附近浓度已高出参考值,由此带来的危害和生态风险不容忽视.

2.2 小清河表层沉积物中细菌多样性分析

PFOA浓度最高的XQ5点位在4月细菌的丰富度和均匀度指数为研究区沉积物各样点最低(表 1). XQ4和XQ5点位物种分类树(图 3)选取相对丰度前10的物种,4月PFOA浓度最低的XQ4其优势菌种为变形菌门(Proteobacteria)的硫杆菌属 (Thiobacillus)、 Dok59、 SulfurimonasSulfuritalea,分别占所选取物种的比率为45.78%、 19.2%、 10.10%、 10.09%; PFOA浓度最高的XQ5其优势菌种为变形菌门(Proteobacteria)的硫杆菌属 (Thiobacillus)和Sulfurimonas,分别占所选取物种的比率为47.56%和47.97%. 表明受高浓度PFOA污染点位的优势菌种类减少,均匀度降低. 优势菌种硫杆菌属(Thiobacillus)在XQ4和XQ5占所有物种的比率为4.52%和22.81%,说明当PFOA浓度较高时硫杆菌属 (Thiobacillus)的含量和比重会明显升高. 7月XQ5 样点PFOA的污染最重,达到748.7 ng ·g-1,但细菌微生物的丰富度和均匀度和其它样点相比没有显著降低.

表 1 4月和7月沉积物细菌群落多样性统计结果 Table 1 Summary of the richness and diversity of bacterial community in the sediment in April and July, 2014

圆圈的大小表示该分类的相对丰度大小,分类名下方数字前者表示占所有物种的比分率,后者表示占所选取物种的百分率图 3 4月XQ4和 XQ5物种分类树 Fig. 3 Species classification trees of XQ4 and XQ5 in April, 2014

有研究表明,硫杆菌属 (Thiobacillus)中的一些种在去除环境中重金属和相关生产工艺上发挥着重 要作用,如氧化亚铁硫杆菌 (Thiobacillus ferrooxidans)和氧化硫硫杆菌 (Thiobacillus thiooxidans)对重金属具有良好的沥滤效果,这种微生物浸矿技术可用于冶炼金属[19]、 废旧线路板中黄金和铜的浸出[20]以及废旧催化剂加工程序[21]; 脱氮硫杆菌(Thiobacillus denitrificans)在废水同步脱硫反硝化处理工艺中起主要作用[22]. 同时有研究证实用于浸铀实验的Thiobacillus thiooxidans适应培养体系的氟浓度能力可达40 mg ·L-1,且其耐氟能力通过驯化可以提高[23]. 以上关于硫杆菌属 (Thiobacillus)在环境中作用和耐氟能力的研究表明该菌属有作为PFOA污染指示菌种和生态效应研究的潜质.

2.3 环境因子与微生物群落关系分析 2.3.1 表层沉积物的环境因子分析

水体及沉积物环境因子值如表 2所示,研究区沉积物整体呈弱碱性,两个月平均温度分别为22.2℃和31.3℃. 整体上,两个月pH值、 含水量、 颗粒物粒度含量差异不大,但DO、 盐度、 氮、 磷营养盐浓度则表现出4月高于7月,4、 7月TN平均浓度分别为0.90 g ·kg-1和0.82 g ·kg-1,全磷平均浓度分别为0.96 g ·kg-1和0.75 g ·kg-1. 大多数样点有机碳含量在7月含量高于4月,尤其是XQ5由14.5 g ·kg-1波动到62.2 g ·kg-1. 4月XQ5环境因子指标与其它样点比无明显差异,而7月该点的有机碳和总氮含量明显高于其它样点,分别为62.2 g ·kg-1和2.7 g ·kg-1. 产生这种现象的原因可能有三点:一是由于年中是氟化工行业生产旺季[24],含大量有机物的工业废水被排放并沉积在河底; 二是微生物生理活动,如对C,N的矿化作用,表现出随着受污染程度加深其周转效率越低[25]; 三是水体沉积物PFOA的吸附行为主要受沉积物中有机碳的影响,化合物的富集随有机碳的增加而增加[26,27].

表 2 4月和7月沉积物样品环境因子 Table 2 Environmental factors of sediment samples in April and July, 2014
2.3.2 冗余分析

对环境因子和细菌群落数据(OTU、Chao、Observed_species、Shannon)进行Pearson相关性分析,并对环境因子进行多次CCA筛选. 结果表明,TOC、 盐度和PFOA浓度是影响该区域4月细菌群落结构的主要环境因子. 基于此进行RDA冗余分析,可以看出,细菌多样性信息的72.4%能够为以上3个变量所解释. 其中,第一排序轴解释信息量达65.5%,第二排序轴为6.9%,群落数据与环境因子排序轴的相关系数为0.8616和0.8186,能够较好地反映样点细菌群落数据与环境因子之间的关系. 由RDA排序图可知(图 4),PFOA是影响细菌群落分布的关键因素,有机碳次之,PFOA与OTU,Chao和Observed_species均呈负相关,与Shannon指数呈极显著负相关(r=-0.780,P<0.01),表明PFOA能显著影响小清河细菌群落丰富度和均匀度. XQ5点位受PFOA影响最为显著,XQ10(位于入海口)受盐度影响最为显著,PFOA次之,其它点位(PFOA浓度低于100 ng ·g-1)与有机碳关系较为密切. 7月环境因子与细菌群落结构之间没有发现明显的相关关系,PFOA对细菌群落影响亦不显著,尚有待进一步研究.

图 4 4月RDA分析结果 Fig. 4 RDA analysis results of sediments in April, 2014

3 结论

(1) 小清河流域沉积物中普遍检出PFASs,并以PFOA为主,4月和7月采样点PFOA含量分别为3.8~456.2 ng·g-1和0.6~7548.7 ng·g-1. XQ5样点位于污染源附近,其PFOA 浓度在4、 7月分别达最高值456.2 ng ·g-1和748.7 ng ·g-1. 该流域PFOA浓度显著高于环渤海其它水系,且7月污染源附近沉积物中PFOA浓度已高出有关参考值. (2) PFOA是小清河4月影响微生物群落结构的关键因子,与群落丰富度和均匀度均呈显著负相关. PFOA污染最重的XQ5点位细菌群落丰富度和均匀度指数为各样点中最低. 但PFOA在浓度较低时(<100 ng ·g-1),对微生物群落结构的影响并不显著. 7月PFOA对细菌群落结构影响不显著. (3) 硫杆菌属(Thiobacillus)在低浓度PFOA条件下数量较少,但在高浓度PFOA下数量较高且成为优势菌种,初步证明硫杆菌属 (Thiobacillus)是PFOA污染响应的敏感物种,有作为指示微生物的潜质.

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